Mascot은 질량분석 데이터를 사용한 단백질 ID의 표준으로 확고하게 자리 잡았습니다.
주요 제조 업체의 질량분석기로 얻은 peak lists와 단백질 데이터베이스를 비교 검색하여 우수한 단백질 ID 결과를 제공합니다.

• AB Sciex 
• Agilent 
• Bruker 
• Jeol 
• Shimadzu 
• Thermo Scientific 
• Waters

Mascot은 peptide mass fingerprint및 MS/MS 데이터베이스 검색이 웹 사이트에서 라이브로 제공됩니다. SwissProt, NCBInr 및 EMBL의 EST divisions 등을 포함한 인기 있는 시퀀스 데이터베이스 목록이 온라인에 있습니다. 이 무료 서비스는 소규모 데이터 세트를 평가하고 검색하는 데 이상적입니다.
Mascot은 웹 사이트에서 무료로 액세스 할 수 있지만 in-house 사용을 위해 Mascot 라이선스를 선택해야 하는 몇 가지 이유가 있습니다.

• 무료 서버에서 크기 제한 을 초과하는 데이터 세트를 검색하는 경우
• 보완 문제로 인해 민감한 데이터를 제 3 자에게 전송하지 못하는 경우
• 선호하는 시퀀스 데이터베이스 컬렉션 검색하는 경우 (모든 Fasta 파일)
• 자동화된 대용량 데이터를 처리하고자 할 경우
• 검색 결과를 관련 데이터베이스로 가져오고자 할 경우
• modification, enzymes, 정량화 방법 등을 추가하고 편집할 경우

Mascot 라이선스 구입시 함께 제공되는 1 년 보증에는 다음과 같은 혜택이 제공됩니다.

• 전문 기술지원에 대한 액세스
• Mascot의 모든 새 릴리스에 대한 무료 업데이트
• 지원되는 다른 플랫폼으로 교체 시 무료

연간 지원 계약을 구매하면 다음 해에도 이러한 혜택을 계속 받을 수 있습니다.

Mascot Distiller Workstation은 Agilent, AB Sciex, Bruker, Shimadzu, Thermo 및 Waters의 native (binary) 데이터 파일에 대한 직관적인 단일 인터페이스를 제공합니다. Raw data는 고품질의 de-isotoped 피크 리스트로 처리할 수 있습니다. Toolbox options을 사용하여 Mascot 검색 결과 검토, 자동 및 수동 de novo sequencing, batch processing 및 정량분석을 할 수 있습니다. 라이선스가 없는 경우에도, Mascot Distiller는 무료 프로젝트 뷰어로 계속 사용할 수 있으며, 검색 및 정량 결과를 동료들에게 배포하는 데 이상적입니다.

Mascot Daemon은 데이터 파일을 Mascot server에 자동으로 제출하는 Microsoft Windows client 응용프로그램으로Mascot Server와 함께 번들로 제공됩니다. 추가 라이선스 비용없이 필요에 따라 설치할 수 있습니다.

Mascot Parser 는 Mascot 결과 파일에 객체 지향 API (Application Programmer Interface)를 제공하므로 Mascot Parser를 사용하면 C ++, C#, Java, Perl또는 Phyton으로 작성된 프로그램이 Mascot 결과에 쉽게 액세스 할 수 있습니다. 상용 소프트웨어 패키지의 일부로 재배포하는 경우를 제외하고 모든 목적으로 무료입니다.